9月28日公布的港交所英文文件显示，在沪股通和深股通标的中，只有A股是合资格的标的，B股、ETF、债券等都不包括在内。
根据8月16日的公布的联合公告，中国证监会与香港证监会已就交易型开放式基金(交易所买卖基金，即ETF)纳入互联互通的投资标的达成共识。但纳入时间将在深股通在运作一段时间和满足相关条件后另行公布。
在沪股通中，香港和海外投资者可以买卖在上交所上市的股票，这些股票包括上证180指数和上证380指数的所有成份股标的，不在上述指数成份股内、但股票同时在上交所和联交所上市的A股，同时排除沪市中不以人民币交易的股票，及带有风险警示的股票。
在深股通中，香港和海外投资者可以买卖深交所上市的股票，这些股票包括市值不少于60亿元人民币的深证成指的成分股和小型/中型创新指数股，以及不在上述指数成份股内、但股票同时在深交所和联交所上市的A股，同时排除深市中不以人民币交易的股票，及带有风险警示的股票。
换句话说，所有被实施风险警示(ST和*ST)的A股，都明确排除在沪港通及深股通标的之外。沪港通和深港通机制仅支持二级市场交易，一级市场活动，比如首次公开发行并不在支持之列。
在沪港通及深港通项目下，买卖上交所及深交所上市 A 股将开放予所有香港与海外投资者，包括机构及个人投资者。惟深港通开通初期，能通过深股通买卖深交所创业板股票的投资者仅限于机构专业投资者。
